วัดซุยกันจินั้นรายล้อมไปด้วยถ้ำเล็ก ๆ มากมายพร้อมด้วยต้นซีดาร์สูงตระหง่านเต็มสองข้างทาง เป็นเวลากว่าร้อยปีมาแล้วที่ผู้ที่เลื่อมใสจากที่ต่าง ๆ ได้เดินทางมาที่นี่เพื่อปฏิบัติธรรม นั่งสมาธิ ไปจนถึงอยู่อาศัยในถ้ำเหล่านี้ ตัววัดในปัจจุปันนั้นถูกสร้างขึ้นในปีค.ศ. 1609 โดยท่านดาเตะ มาซามุเนะ ผู้ก่อตั้งเมืองเซนได ที่ได้ออกคำสั่งให้สร้างวัดซุยกันจิเป็นวัดประจำตระกูลของท่าน ท่านดาเตะได้นำไม้และช่างฝีมือจากเมืองเกียวโตมาเพื่อสร้างวัดนี้โดยเฉพาะ เพื่อให้เหมาะสมดับบารมีของท่าน ซึ่งทำให้วัดนี้มีลักษณะบางส่วนคล้ายปราสาทในยุคนั้น

ฮอนโด (อุโบสถหลัก) ที่ได้ถูกบันทึกเป็นสมบัติแห่งชาติ มีทางเข้าและห้องสำหรับต้อนรับจักรพรรดิโดยเฉพาะ ห้องหลักถูกตกแต่งด้วยภาพวาดลายทองที่แสดงถึงฤดูกาลต่าง ๆ ที่ด้านหลังของฮอนโดมีอิไฮ (แผ่นจารึกทางศาสนาพุทธ) ขนาดใหญ่อยู่ 3 แผ่นเพื่อเป็นเกียรติแก่ซามูไรผู้ปกครองเซนได 3 ท่านแรก ด้านในและนอกของอาคารเค็มไปด้วยศิลปะแกะสลักบนไม้เป็นรูปสัตว์ทั้งที่มีอยู่จริงและมาจากนวนิยาย ถัดไปจากฮอนโดคือ คุริ (ครัวของวัด) ที่มีทั้งขนาดและการตกแต่งตามรสนิยมของท่านดาเตะ มาซามุเนะ พิพิธภัณฑ์ของวัดแห่งนี้ได้จัดแสดงสมบัติต่าง ๆ รวมไปถึงดาบซามูไรและรูปปั้นของท่านดาเตะที่สวมหมวกรูปพระจันทร์เสี้ยวอันเป็นเอกลักษณ์ ซึ่งถูกบริจาคโดยภรรยาของท่านดาเตะ หลังจากท่านได้เสียชีวิตไป